<script>
         var Sone = "Это тестовый пример для поиска одинаковых слов в предложениях. 
Он больше подходит для словарей и поиска слов в именительном падеже, такие как - массив, 
носорог, яваскрипт, код, он",
         Stwo = "Сперва для этого сделаем массив. И данный код будет разбивать на слова и предлоги 
в предложениях и заносить результаты в данный массив. ",
        Smarks = ",.!?-;<>[]()@#$%^&* "; //Создаем строку, необходимую для поиска знаков 
                                        //препинания и символов, не относящихся к словам
    var ArrayWords = []; //Создаем массив для того, чтобы заносить в него слова
    var tempString = ""; //Строка, необходимая для хранения слова из строки
    var counterWord = 0; //Счетчик массива ArrayWords
 
//Для начала проанализируем нашу строку "Sone" и разобьем ее на слова.
 
for (var i = 0; i < Sone.length; i++) {
         if (Smarks.indexOf(Sone[i])==-1) {
         tempString += Sone[i];     
         } else {
         if (tempString != '') {ArrayWords[counterWord] = tempString; counterWord++; }
            tempString = "";
    }
}
//Следующим шагом будет написание функции, для удаления одинаковых слов в массиве.
//Не пугайтесь. Не будет огромных циклов, всё сделаем внутреннеми средствами JS
 
function uniqueWordsFromArray(value, index, self) {
    return self.indexOf(value) === index;
}
 
//Вот и всё. Функция готова. Сама функция onlyUnique проверяет данные массива.
//Если данное значение является первым - возвращаем true. Если нет, то он должен быть дубликатом 
//и возвращаем false и не копируем его.
// Далее вводим новую переменную unique куда и будем заносить отсортированные слова из массива 
//ArrayWords
// Используяметод filter.
 
var uniqueWords = ArrayWords.filter( uniqueWordsFromArray );
 
// Это решение работает без каких-либо дополнительных библиотек, как JQuery или prototype.js.
// Функция работает и для массивов со смешанными типами данных
 
// А теперь, используя наш псевдословарь, сделанный из слов первой строки, найдем совпадения и 
//выведем их на экран
 
 
for (var i = 0; i < uniqueWords.length; i++) {
         if (Stwo.indexOf(uniqueWords[i])!=-1) {
            document.write(uniqueWords[i]+"<br/>");    
         }
}
 
</script>

<script>
 
function SearchUniqueWords(Sone,Stwo) {
    var Smarks = ",.!?-;<>[]()@#$%^&* "; //Создаем строку, необходимую для поиска знаков 
                                        //препинания и символов, не относящихся к словам
    var ArrayWords = []; //Создаем массив для того, чтобы заносить в него слова
    var tempString = ""; //Строка, необходимая для хранения слова из строки
    var counterWord = 0; //Счетчикмассива ArrayWords
    var uniqueWords = [];
 
for (var i = 0; i < Sone.length; i++) {
         if (Smarks.indexOf(Sone[i])==-1) {
         tempString += Sone[i];     
         } else {
         if (tempString != '') {ArrayWords[counterWord] = tempString; counterWord++; }
            tempString = "";
    }
}
 
         function uniqueWordsFromArray(value, index, self) {
                   return self.indexOf(value) === index;
         }
 
uniqueWords = ArrayWords.filter( uniqueWordsFromArray );
ArrayWords = [];
 
for (var i = 0; i < uniqueWords.length; i++) {
         if (Stwo.indexOf(uniqueWords[i])!=-1) {
          ArrayWords.push(uniqueWords[i]);  
         }
}
 
return ArrayWords;
}
 
var Soutone = "Это тестовый пример для поиска одинаковых слов в предложениях. Он больше подходит 
для словарей и поиска слов в именительном падеже, такие как - массив, носорог, яваскрипт, код, он",
Souttwo = "Сперва для этого сделаем массив. И данный код будет разбивать на слова и предлоги в 
предложениях и заносить результаты в данный массив. ";
 
var ArrayGlobal = SearchUniqueWords(Soutone,Souttwo);
         document.write(ArrayGlobal.join("<br />"));
 
</script>